上海食品經營許可證網上辦理流程如下：

1. 登陸上海市“一網通辦”平臺，選擇“食品經營許可證”申請條目。
2. 填寫相關信息，并提交申請。
3. 等待審批，申請人需根據短信提示進入線上審核流程。
4. 打印回單，完成申請。

申請食品經營許可證時需要提交的資料包括：

1. 營業執照或者其他主體資格證明文件的復印件。
2. 經營場所的房屋租賃合同以及復印件。
3. 經營場所平面圖。
4. 經營者或者負責人的一寸免冠照片一張。
5. 負責人及食品安全管理人員的身份證原件及復印件。
6. 食品安全管理制度文本。

以上信息僅供參考，不同申請類型可能所需資料有所不同，建議咨詢相關部門獲取準確信息。