上海食品經營許可證網上申請流程如下：

1. 登錄上海市市場監督管理局官網（https://sh.samsco.gov.cn），點擊“許可辦”。
2. 點擊“食品生產許可”板塊中的“在線辦理”，進入頁面后輸入賬號、密碼登錄。
3. 根據自身經營情況填寫申請信息，提交相應資料。

食品生產經營許可證的頒發和監管請咨詢上海市市場監督管理局。辦理食品經營許可證，您需要提供以下材料：

1. 《食品經營許可證申請表》
2. 企業名稱預先核準通知書復印件。
3. 經營場所使用證明，包括房產證、租賃合同。
4. 負責人及食品安全管理人員的身份證原件及復印件。
5. 食品安全管理制度，包括制度文本和裝訂成冊的紙質材料。
6. 委托辦理的，需提供委托書。

以上信息僅供參考，如果您還有疑問，建議咨詢辦理食品經營許可證的相關部門獲取專業指導。另外，您可以提供營業執照上的公司名稱和統一社會信用代碼在“企信網”查詢地址。食品經營許可證辦理流程可能因地區規定不同，詳情請咨詢當地市場監督管理局。