上海申請食品經營許可證的流程和所需資料如下：

流程：

1. 經營業主登錄“上海市市場監督管理局”進行用戶注冊。
2. 填寫申請信息，并使用能上網的“電子營業執照”掃碼認證。
3. 遞交申請材料。
4. 等待局方審核，如果申報材料有誤，可在系統后臺在線修改。
5. 接到現場檢查通知后，按要求整理好相關資料和設備。
6. 食品藥品監管局會在20個工作日內做出準予許可和不予許可的決定。準予許可的，食品經營者要在法定檢驗機構進行檢驗，檢驗合格的，頒發食品經營許可證。

所需資料：

1. 《食品經營許可申請書》。
2. 企業營業執照復印件。
3. 自擬的規章制度。
4. 如果委托辦理還需要提交委托書以及被委托人的身份證明。

以上信息僅供參考，具體流程和所需資料可能因各地要求而有所不同，建議咨詢相關部門獲取具體信息。同時，申請食品經營許可證需要一定的時間和精力，請提前規劃好時間，并確保準備充足的材料。